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西湖大学医学院的郭天南教授及其合作者们,通过对近 3000 份人体组织样本进行分析,这些样本涵盖了 58 种正常组织和 25 种癌症类型。他们对超过 1.3 万种蛋白质进行了定量研究,创建了迄今为止分辨率最高、覆盖面最广的人体蛋白质空间分布图。
蛋白质作为生命活动的主要执行者,同时也是多数药物作用的关键靶点。长期以来,科学界对于蛋白质在人体内整体的空间分布缺乏系统性的了解。郭天南团队开发了一种分析微量样本蛋白质组的方法。这种新方法使得研究人员只需使用如芝麻大小的组织样本,就能进行标准化的蛋白质组学分析。
该技术不仅将分析效率提升了约十倍,还大幅降低了实验成本,为进行大规模、高通量的蛋白质组学研究提供了技术支撑。通过持续的样本收集和实验分析,研究团队建立了一个包含 15332 种蛋白质的数据库,并在此基础上对 13609 种蛋白质进行了精确的定量分析,从而构建了人体蛋白质组的“高精度地图”。
利用这张蛋白质“地图”,研究团队对比了 25 种癌症中肿瘤组织与相邻正常组织的蛋白质表达差异,共确定了 8940 个表达量不同的蛋白质。研究结果表明,不同癌症类型的蛋白质变化幅度存在显著差异,其中结肠癌、直肠癌以及睾丸癌组织的蛋白质变化最为显著。
此外,研究团队还发现了 2879 个肿瘤特异性蛋白质,这些蛋白质仅在某些特定类型的癌症中表现出变化。
值得注意的是,这项研究成果已发表在《自然》杂志上,题为“Spatial distribution of the proteome in the human body and in cancers”。所有研究数据已通过公开数据库 db.prottalks.com 面向全球开放,研究人员可以查询蛋白质在 58 种人体组织中的表达丰度,并可比较不同癌症中的蛋白质变化情况。
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